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雲林縣
 國立臺灣大學醫學院附設醫院雲林分院(斗六、虎尾)
 國立成功大學醫學院附設醫院斗六分院
 財團法人天主教若瑟醫院
 彰化基督教醫院雲林分院
 中國醫藥大學北港附設醫院
嘉義縣市
 長庚醫療財團法人嘉義長庚醫院
 財團法人慈濟佛教醫院大林分院
 台中榮總灣橋分院
 衛生福利部嘉義醫院
 臺中榮民總醫院嘉義分院
 戴德森醫療財團法人嘉義基督教醫院
 財團法人天主教聖馬爾定醫院
台南市
 國立成功大學醫學院附設醫院
 衛生福利部新營醫院
 衛生福利部臺南醫院
 奇美醫療財團法人奇美醫院
 奇美醫療財團法人柳營奇美醫院
 高雄榮民總醫院臺南分院
 新樓醫療財團法人麻豆新樓醫院
 新樓醫療財團法人臺南新樓醫院
 臺南市立醫院
 郭綜合醫院
 臺南市立安南醫院-委託中國醫藥大學興建經營
高雄市
 高雄榮民總醫院
 高雄醫學大學附設中和紀念醫院
 長庚醫療財團法人高雄長庚紀念醫院
 義大醫院
 高雄市立聯合醫院
 衛生福利部旗山醫院
 高雄市立小港醫院
 高雄市立大同醫院
 國軍高雄總醫院
 國軍高雄總醫院左營分院
 國軍高雄總醫院岡山分院
 阮綜合醫院
 天主教聖功醫療財團法人聖功醫院
屏東縣
 衛生福利部屏東醫院
 屏基財團法人屏東基督教醫院
 寶建醫療社團法人寶建醫院
 國軍高雄總醫院附設民眾診療服務處
 國仁醫院
 安泰醫療社團法人安泰醫院
 輔英科技大學附設醫院
 衛生福利部恆春旅遊醫院

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